天然砭石的主要成分是一种称为“微晶灰岩”的矿物质，其中最多的是锶、氧化钙，其次是氧化硅、氧化钠等，还有铝、铁、镁、磷等多种元素，微量元素及稀土元素含有铬、锰、镍、铜、钇等超过36种对人体有益的元素，放射性物质含量极微。

同时部分砭石中含有铜、铁等金属物质，致使砭石会呈现红、黄、绿等颜色。辨别砭石最重要应当看化学元素分析，也就是我们常说的检测报告。